11月17日，湾仔码头速冻水饺在南京被检出含金黄色葡萄球菌。至此国内三大速冻食品品牌全部沦陷。这使得业界对于卫生部速冻食品新标准再次产生质疑。
今年9月6日，卫生部新发布的食品安全国家标准《速冻面米制品（征求意见稿）》“生制品的微生物限量”中规定，每克生制品中检出的金黄色葡萄球菌含量只要在1000-10000个之间，都为合格。
这一规定与国标相左，也使得生产企业、检验机构无所适从。因为根据现行的《速冻预包装面米食品卫生标准》（GB19295-2003），金黄色葡萄球菌要求“不得检出”。
11月11日，卫生部公布“速冻面米食品微生物指标问题”一文回应称，金黄色葡萄球菌广泛分布存在，对热敏感，加热80℃，30分钟可被杀灭。另外，原来“不得检出”的规定显得不够全面，无法反映微生物污染的真实情况和对人体的影响。
在《征求意见稿》中，卫生部采用了“国际微生物规格委员会”（ICMSF）三级采样方案，用多个样品定量检测结果进行综合判定，而该国际组织对金黄色葡萄球菌的限量标准为100-10000个。
南京市工商局并未明确指出湾仔码头产品的金黄色葡萄球菌含量，湾仔码头品牌的拥有人通用磨坊中国公司则发表声明称：“卫生部已经正式发文，金黄色葡萄球菌普遍少量存在于自然界，经蒸煮无害健康。”
企业急于用卫生部的解释做挡箭牌，对其自身问题却视而不见。
速冻食品温度需在零下摄氏25度以下迅速冻结，在零下18度或更低温度条件下贮藏运输、保存。但是目前速冻水饺行业整个生产、流通环节，并没有企业能全程符合国家要求，极可能导致细菌超标。
11月17日，国内某知名冷冻食品企业市场总监李志勇表示，“金黄色葡萄球菌无处不在，具体细菌超标在哪个环节，是原料、产品制作过程、物流还是终端零售，至今还没有一个明确答案。”